เครื่องมือหลัก ๆ ของการให้บริการกล้องจุลทรรศน์ที่สำคัญคือ

1. กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน เป็นกล้องจุลทรรศน์ที่มีกำลังขยายสูง ถึง 800,000 เท่า สามารถใช้ศึกษาวัตถุที่มีขนาดเล็กได้ถึงระดับนาโนเมตร ทำให้สามารถศึกษาวัตถุที่มีขนาดเล็กมากเช่น ไวรัส หรืออนุภาคของสารประกอบ รวมถึงสามารถตรวจสอบความผิดปรกติของอุปกรณ์ขนาดเล็กๆ เช่น ชิ้นส่วนอิเล็กทรอนิกส์ได้ ซึ่งฝ่ายเครื่องมือฯ มีกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน 2 ชนิดคือ

1.1 กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราด (Scanning electron microscope: SEM-Hitachi SU8020)
เป็นกล้องจุลทรรรศน์ที่ใช้ศึกษาพื้นผิวของตัวอย่าง โดยลำอิเล็กตรอนจะส่องกราดไปบนผิวของวัตถุ ทำให้ได้ภาพซึ่งมีลักษณะเป็นภาพ 3 มิติ กำลังขยาย 20-800,000 เท่า

1.2 กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องผ่าน ( Transmission electron microscope: TEM-Hitachi HT7700)
เป็นกล้องจุลทรรรศน์ที่ใช้ศึกษารายละเอียดภายในของเซลล์หรือตัวอย่างวัตถุที่นำมาศึกษา ซึ่งให้ภาพ 2 มิติ กำลังขยาย 50-600,000 เท่า

2. เครื่องวิเคราะห์ธาตุเชิงพลังงาน ( Energy dispersive x-ray spectrometer: EDS)
เป็นเครื่องมือที่ใช้งานร่วมกับกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบส่องกราดและส่องผ่าน ซึ่งสามารถศึกษา ชนิด ปริมาณ และการกระจายขององค์ประกอบธาตุของวัสดุหรือสารมลทินบนพื้นผิวของวัสดุที่นำมาศึกษาได้ เครื่องนี้สามารถวิเคราะห์ธาตุได้ตั้งแต่ boron (B) ถึง uranium (U) โดยการวิเคราะห์สามารถแสดงผลเป็นชนิดและปริมาณของธาตุ รวมถึงสามารถทำ map และ line scan ( เฉพาะที่ติดตั้งกับ SEM เท่านั้น ) ได้อีกด้วย ซึ่งข้อมูลที่ได้สามารถนำไปใช้ในการปรับปรุง และพัฒนา งานวิจัย งานในกระบวนการผลิต งานวิเคราะห์ความเสียหายของวัสดุ งานแก้ไขปัญหาอุตสาหกรรม และงานควบคุมคุณภาพของวัสดุได้เป็นอย่างดี

เครื่องวิเคราะห์ธาตุเชิงพลังงาน (Energy dispersive x-ray spectrometer: EDS)

3. Inverted Fluorescent Microscope ใช้ Mercury lamp เป็นแหล่งกำเนิดแสง ส่องดูเซลล์ที่ย้อมด้วยสารเรืองแสง

Inverted Fluorescent Microscope

4. Fluorescence stereo microscope

Fluorescence stereo microscope [Leica M205FA]

กล้องสเตอริโอแบบ 3 มิติ ชนิด fluorescence ประกอบด้วย filter 3 ชนิดได้แก่ DAPI (ex: 410 nm, em: 455 nm), GFP (ex: 470 nm, em: 525 nm) และ mCherry (ex: 560nm, em: 630nm) พร้อม กล้องถ่าย ภาพ digital ชนิด cooled camera และโปรแกรม LasX สำหรับการประมวลผล

คุณสมบัติของกล้องสเตอริโอ มีอัตราส่วนกำลังขยาย 20.5:1 มีกำลังขยายสูงสุด 160 เท่า สามารถแสดงภาพที่มีรายละเอียด และระยะชัดลึกได้สูงสุด การเกิดแสงกระตุ้น (excitation) และแสงสะท้อน (emission) ไม่รบกวนซึ่งกันและกัน ทำให้ภาพที่ได้มีความคมชัด นอกจากนี้ยังมี filter band pass แบบพิเศษเพื่อลดการเกิด auto-fluorescence ได้อีกด้วย

นอกจากเครื่องมือดังกล่าว ฝ่ายเครื่องมือและวิจัยทางวิทยาศาสตร์ยังให้บริการกล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสง (Light microscope) และบริการทำสไลด์ถาวรตัวอย่างพืชและตัวอย่างสัตว์ และบริการอุปกรณ์ประกอบอื่น ๆ ที่ใช้ในการเตรียมตัวอย่าง เช่น Critical point dryer, Ion coater, Vacuum evaporator และ Ultra microtome