โครงการเคยู - ไบโอดีเซล เป็นโครงการที่ทำการศึกษาและวิจัยแบบบูรณาการเกี่ยวกับน้ำมันไบโอดีเซล โดยมีแผนงานหลักแบ่งออกได้เป็น 3 แผนงาน อันได้แก่ 1) แผนงานที่เกี่ยวกับการผลิตสบู่ดำ การปรับปรุงพันธุ์และการปลูกสบู่ดำ 2) แผนงานที่เกี่ยวกับเทคนิคการผลิตไบโอดีเซลจากน้ำมันสบู่ดำ และ3) แผนงานที่เกี่ยวกับการใช้ประโยชน์และเพิ่มมูลค่าของเหลือทิ้งจากการผลิต โดยผลการศึกษาจากแผนงานที่ 1 ทำให้ได้องค์ความรู้ที่ใช้จัดการต้นสบู่ดำในด้านต่างๆ เช่น วิธีการปลูก ระยะปลูก รูปแบบการตัดแต่งกิ่งที่เหมาะสม การเลือกใช้ธาตุอาหาร ฮอร์โมนหรือสารต่างๆ วิธีการขยายพันธุ์รูปแบบต่างๆ ข้อมูลของโรค ชนิดของศัตรูพืชและศัตรูธรรมชาติที่มักพบ ส่วนผลจากวิจัยในแผนงานที่ 2 ทำให้เข้าใจถึงปฏิกิริยาในการผลิตไบโอดีเซลและปัจจัยต่างๆที่ส่งผลต่อการเปลี่ยนเป็นไบโอดีเซลของน้ำมันสบู่ดำ อีกทั้งทราบถึงวิธีที่เหมาะสมในการผลิตไบโอดีเซลจากน้ำมันสบู่ดำ ส่วนผลจากการศึกษาในแผนงานสุดท้าย จะทราบถึงวิธีในการเพิ่มมูลค่าของส่วนต่างๆจากสบู่ดำ เช่น กาก เ      ปลือก เมล็ด กิ่งก้าน และลำต้นสบู่ดำ รวมถึงการเพิ่มมูลค่ากลีเซอรอลดิบ ซึ่งเป็นผลิตภัณฑ์ข้างเคียงจากการผลิตไบโอดีเซลด้วย

                ผลจากแผนงานแรกจะช่วยเกษตรกรและผู้ที่สนใจสามารถปลูกและดูแลแปลงสบู่ดำได้เป็นอย่างดี เนื่องจากทราบวิธีการเขตกรรมที่เหมาะสม อีกทั้งปัจจัยสำคัญต่างๆที่มีผลกระทบต่อสบู่ดำ ส่งเสริมให้เกษตรกรสามารถจัดการแก้ปัญหาต่างๆในเบื้องต้นได้ด้วยตนเอง ส่วนแผนงานที่สองจะทำให้ทราบเทคนิคและวิธีในการผลิตไบโอดีเซลที่เหมาะสม ซึ่งสามารถนำไปต่อยอดเพื่อใช้พัฒนาการผลิตไบโอดีเซลในระดับอุตสาหกรรมได้ ส่วนแผนงานสุดท้าย จะช่วยให้เกษตรกรสามารถใช้ประโยชน์จากสบู่ดำทุกส่วนได้อย่างครบวงจร ทั้งนี้เพื่อให้มีรายได้ตลอดจากการปลูกสบู่ดำตั้งแต่แรกเริ่มไปจนถึงออกผล ทั้งนี้เพื่อให้เกษตรกรสามารถพึ่งพาตัวเองได้ ซึ่งผลรวมจากทั้งแผนงานทั้งสามนี้จะส่งผลดีต่อประเทศไม่ว่าในแง่ของเศรษฐกิจและสังคม

                โครงการฯ ได้ทำการเผยแพร่และถ่ายทอดองค์ความรู้ที่ได้จากการวิจัยออกมาในหลายรูปแบบ ไม่ว่าจะเป็นการจัดอบรมการผลิตน้ำมันไบโอดีเซล ซึ่งได้ทำอย่างต่อเนื่องมาตั้งแต่ปี พ.ศ.2548 จนถึง ณ ปัจจุบันนี้ได้เปิดอบรมมาแล้วทั้งสิ้น 26 รุ่น นอกจากนี้ยังได้มีการจัดทำโครงการต่างๆ ร่วมกับหน่วยงานภาครัฐบาล คือ กรมพัฒนาพลังงานทดแทนและอนุรักษ์พลังงาน กระทรวงพลังงาน ได้แก่ โครงการศึกษาและกำหนดรูปแบบการจัดการสบู่ดำเป็นเชื้อเพลิงอย่างครบวงจร, โครงการสาธิตการผลิตไบโอดีเซลชุมชนโดยจัดทำต้นแบบผลิตไบโอดีเซลในประเทศสหภาพพม่า, การประชุมสัมมนาเปิดโครงการส่งเสริมพัฒนาคุณภาพไบโอดีเซลและการลดของเสียจากขบวนการผลิต (พัฒนาคุณภาพการผลิตไบโอดีเซลตามมาตรฐานเชิงพาณิชย์) เป็นต้น และร่วมทำโครงการวิจัยกับหน่วยงานภาคเอกชน อาทิ โครงการความร่วมมือระหว่างปตท. (มหาชน) กับเคยู-ไบโอดีเซล ในการวิจัยเพิ่มผลผลิตของสบู่ดำเพื่อเป็นแหล่งพลังงานทดแทนในอนาคต ร่วมกับบริษัท ปตท. จำกัด (มหาชน), โครงการทดสอบเปรียบเทียบพันธุ์สบู่ดำที่เหมาะสม ในการปลูกในพื้นที่ภาคตะวันออกเฉียงเหนือ และโครงการทดสอบกากสบู่ดำในรูปของปุ๋ยต่อผักชนิดต่างๆ ร่วมกับบริษัท ดี1 ออยล์ พล้านท์ ไซเอนซ์ (ประเทศไทย) จำกัด และโครงการพัฒนาพันธุ์สบู่ดำเพื่อใช้ในเครื่องยนต์รถดีเซล ที่ทำร่วมกับบริษัทโตโยต้า มอเตอร์ (ประเทศไทย) จำกัด เป็นต้น